Un escaneo explorativo del genoma de la abeja ibérica para detectar loci candidatos a selección
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Estudios explorativos del genoma se ha convertido en un abordaje popular para detectar selección permitiendo un análisis de la adaptación local y especiación a nivel molecular en poblaciones. La abeja ibérica (Apis mellifera iberiensis) ha sido estudiada con una variedad de marcadores genéticos como alozimas, DNA mitocondrial y microsatélites, pero estos han revelado complejos patrones y procesos que aún deben ser analizados minuciosamente. En los últimos años, las nuevas tecnologias han facilitado el uso de polimorfismos de nucleótidos simples (SNPs), siendo el marcador genético de elección para muchos genetistas. Con el secuenciamiento de genomas de varias especies, estos marcadores pueden ser producidos en altos números y permitir examinar tanto la variación neutral y regiones con señal de selección en el genoma. En este estudio, un total de 711 A. m. iberiensis fueron colectados en la Península Ibérica y 1536 SNPs fueron genotipados usando la técnica de Illumina GoldenGate Assay. El conjunto de datos de SNPs fue analizado para detectar selección usando cinco métodos: a) Coalescencia – FDIST y Arlequín b) Bayesiano – BAYESCAN y BAYESFST, y c) Análisis espacial – MatSAM. Usando estos diferentes abordajes fueron detectados 17 loci con mayor señal de selección. La posición en el genoma y funciones de posibles de genes, dados en los recursos genómicos para la abeja de la miel, sugiere que estos loci detectados son fuertes candidatos para selección.
