BBMS++ – metapesquisador bioinformático
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Neste artigo descreve-se a criação implementação de um meta-pesquisador [1-7] na área
da bioinformática (BBMS – Basic Bioinformatics Meta-searcher), desenvolvido de raiz
na língua portuguesa. O BBMS permite um acesso centralizado aos motores de busca
online das principais bases de dados biológicos primárias, bastante fácil de entender e
que permite aceder a informação biológica contida nas mais importantes bases de dados
públicas mundiais, sem que, para isso o utilizador tenha que sair do “website”
desenvolvido. O BBMS tem sido actualizado para abranger um maior leque de frontes
de bioinformação, mas centra-se mormente em nucleótidos, proteínas e vias metabólicas
[8,9]. Adicionalmente, o BBMS também pesquisa bibliografia científica nas principais
publicações de índole bioinformática. O programa é autónomo, apenas é necessário
introduzir as palavras-chave da pesquisa e apontar para que base de dados a pesquisa
deve ser feita. Por defeito, os resultados são disponibilizados em Inglês, mas um painel
de tradução, incorporado no nosso meta-pesquisador, permite que estes sejam
traduzidos para várias línguas, incluindo o Português, em tempo real e sem demoras.
Outro aspecto importante é a pesquisa global na Internet, que pode ser utilizada quando
o utilizador não sabe onde procurar especificamente. Deste modo, o meta-pesquisador
BBMS realiza a pesquisa em bases de dados, motores de busca específicos, bancos de
imagens e vídeos, entre outros locais relevantes. Para esta operação, baseia-se no
funcionamento do “Bioinformatic Harvester” [10], um outro meta-pesquisador.
Outra aplicação integrada no BBMS é a pesquisa por artigos científicos, permitindo
uma pesquisa rigorosa nas bases de dados mais importantes.
Na segunda versão do BBMS, o BBMS++, além das melhorias gráficas, foi adicionado o
acesso a aplicações bioinformáticas online, tais como a realização de “BLAST's” e “e-
PCR”, entre outras.
De modo a ter uma percepção da usabilidade, utilidade e eficiência do BBMS foi levado
a cabo um inquérito, envolvendo cerca de 30 inquiridos, sendo os resultados finais
muito satisfatórios.
O BBMS++ está acessível em http://www.esa.ipb.pt/bbms